Мұражай коллекциясының негізгі қоры Нұрлан Смағұловтың жинағынан тұрады. Музейдің негізін қалаушы кейінгі отыз жылда жинап, мұқият сақтаған қазақстандық өнер шеберлерінің 700 туындысын қорға өткізіп отыр.

​

Бұл ірі жеке коллекция саналады. Бастапқыда Н.Смағұлов Алмагүл Меңлібаева, Эдуард Казарян және Асқар Есдәулетов сияқты өз замандастарының жұмыстарын жинаған. Біртіндеп алпысыншы жылдардағы қазақстандық суретшілердің шығармашылығына аңсары ауып, кейін халықаралық модернизм мен заманауи өнер туындыларын да жинай бастаған. 

 

Бүгінде Almaty Museum of Arts коллекциясында Айша Ғалымбаева, Салихитдин Айтбаев, Молдахмет Кенбаев, Исатай Исабаев, Мақым Қисамединов, Рысбек Ахметов, Шаймардан Сариев, Тоқболат Тоғызбаев, Жаңатай Шәрденов сияқты көрнекті қазақстандық шеберлердің туындылары бар. Сонымен бірге біраз өмірін Қазақстанда өткізген Сергей Калмыков, Серенжаб Балдано және Павел Зальцман бастаған суретшілердің туындылары да енді. 

​

Жуырда коллекциямызға қазақстандық суретшілердің келесі буын өкілдері Рустам Хальфин, Сергей Маслов, Ерболсын Мелдібеков, Сәуле Сүлейменова және Саид Атабековтің жұмыстары, сонымен бірге Орталық Азия аймағының заманауи өнер шеберлерін де қамтып, Өзбекстаннан Саодат Исмаилованың, Қырғызстаннан Жазгүл Мадазимованың жұмыстары қосылды. Музей коллекциясындағы халықаралық диалог Хадим Али, Сюй Чжэнь және Жадэ Фадоютими секілді суретшілердің жұмысында көрініс тауып, көпқырлы мәдени байланыстың жаһандық деңгейдегі болашағын көрсетіп отыр. 

​

Музей Ричард Серра, Ансельм Кифер, Яёи Кусама және Билл Виола бастаған әлемдік деңгейдегі шеберлердің бірегей туындыларын, сондай-ақ музейімізге арнап жасалған Йинка Шонибаре, Жауме Пленса және Алисия Кваденің монументал жұмыстарын мақтан тұтады. 

 

Коллекцияны толықтырып отыру стратегиясы Қазақстан, Орталық Азия, көршілес аймақтар мен басқа да елдердің заманауи өнерін ұсынуды кеңейте түсуге бағытталған, олар түрлі медиа, жанр және перспективаны қамтиды.